如果采用机械通风，则气流的方向必须向内。排出的空气要排到室外，不得在建筑物内循环使用。如有窗户，必须是安全、抗击碎的。实验室设备厂家如果窗户可以打开，则必须安装防节肢动物的纱网。可能产生气溶胶的工作必须使用生物安全柜（Ⅰ级或Ⅱ级）或隔离箱，隔离想要带有专用的供气或经HEPA过滤的排气装置。动物尸体必须焚烧。
实验室都应有供排水装置，排水装置最好用聚氯乙烯管，接口用焊枪焊接。化学检验实验台有可能都应安装水管、水龙头、水槽、紧急冲淋器、洗眼器等，一般实验室的废水无须处理就可排入城市下水网道，而实验室的有害废水必须净化处理后才能排入下水网道。
风淋室装于洁净室入口时,其与洁净室墙板间不可有空隙,尚若有空气泄漏现象时，请以填缝剂修边处理,并请注意设备安装之水平度，否则影响开门及耐用性。设备分有底座及无底座型，有底座型可直接调水平后，用硅胶填补修饰。无底座型需以膨胀螺丝固定后，以硅胶填补修饰之。
现代化的实验室都应建设配套的污水处理站，一般实验室的废水无须处理就可排入污水处理站进行处理，对高浓度的酸碱废水应先中和再排入污水处理站，对此类废水的排放建议采用耐酸减的排水管道，从实验室直接排放到处理站，对大量使用有机溶剂的实验室应安装耐有机溶剂的排水管道，例如可采用铸铁管接入污水处理站，也就是说，实验室应根据不同功能，采用不同材料的排水管道，分别设计相互之间不交叉，分别排放到污水处理站。实验室的有害废水必须净化处理后才能排入下水网道。
动物设施适用于专门接种了危险度三级微生物的动物，或根据危险度评估结果来确定。所有系统、操作和规程每年都需要重新检查及验证。必须符合一级和二级生物安全水平动物设施的所有要求。设施必须通过有双门入口构成的缓冲间，以便于实验室的其他部分及动物房隔开。缓冲间内必须配备洗手设施。缓冲间内必须配备淋浴设施。必须采购机械通风，以确保连续的气流通过每个房间。室内空气排出到室外前，必须经HEPA过滤，不得循环使用。系统的设计必须可以防止意外逆流及动物室内出现正压。
